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分子动力学模拟

分子动力学模拟

概要:
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b分子动力学是一门结合物理,生物,数学,化学和计算机科学的综合技术。分子动力学是一套分子模拟方法。该方法主要是依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动,从由分子体系的不同状态构成的系统中抽取样本,从而计算体系的构型积分,并以构型积分的结果为基础进一步计算体系的热力学量和其他宏观性质。

 

从统计物理学中衍生出来的分子动力学模拟方法(Molecular Dynamics Simulation),是指对于原子核和电子所构成的多体系统用计算机模拟原子核的运动过程。其中每一个原子核在经验势场作用下,按牛顿定律运动。分子动力学模拟是分子模拟中最接近实验条件的模拟方法,能够从原子层面给出体系的微观演变过程,直观的展示实验现象发生的机理与规律,促使我们的研究向着更高效,更经济,更有预见性的方向发展,因此,分子动力学模拟在生物,药学,化学,材料科学的研究中发挥着越来越重要的作用。

 

分子动力学可以模拟并记录生物分子在生理环境下的状态变化,来计算模拟前后体系能量的变化,例如:

1、计算生物分子间的自由结合能,相互作用类型、数量 ,为药物后续优化改造提供指导。

2、模拟蛋白质的折叠状态。

3、预测靶点与药物之间的结合状态,探究药物活性机理。

 

佰翱得可以进行蛋白质,核酸,以及小分子等多种体系的模拟,为客户的药物开发提供优质解决方案。

 

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