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分子建模

分子建模

概要:
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分子建模是一个广泛的研究领域,包括对分子结构和活性的分析和预测。佰翱得专注于生物大分子的结构及与配体复合物结构的分子建模服务,还能与结构预测,对接和分子动力学模拟等协作。

 

我们的优势
1、与实验方法相比,计算建模大大降低了成本
2、计算周期短,速度快
3、计算精度高

 

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1. 蛋白质同源建模
同源建模是基于模板蛋白将氨基酸序列转化为三维结构的手段,是目前蛋白质三维结构预测最有效的方法,对于没有报道结构的蛋白质,同源建模是一种重要而有效的辅助方法。基于同源蛋白质三维结构的保守性理论,在蛋白质序列同源性大于30%的前提下,结构未知的蛋白质可以使用一种或多种相关结构为模板来构建他们的三维结构。构建的蛋白质模型可用于后续的分子机制研究。

 

2. 蛋白质从头设计
从头设计也称为“逆蛋白质折叠问题”,是构建具有预定结构和功能的蛋白质的一种有吸引力的方法。从头设计的基础是识别可以正确折叠成所需结构拓扑的初级序列。在深入了解蛋白质的结构和相关功能后,主干构建是第一步也是必不可少的步骤,其中 α-螺旋、β-链和环等次要元素在机器学习和特定计算算法的帮助下进行组装生成合适的序列并优化所需的构象。佰翱得能为蛋白质工程提供从头设计相关服务,包括蛋白质结构预测、蛋白质折叠与相互作用、稳定性预测等。

 

 

 

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联系我们

联系电话:+86 (510) 8613-0005

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